Pembalap CFMoto Aspar Team berhasil menempati posisi terdepan dalam kualifikasi di Misano setelah sebelumnya meraih pole position dan kemenangan di Circuit de Barcelona-Catalunya. Dengan mencatat waktu 1:34,216 di Q2, ia berhasil mengalahkan Vietti dan ManuGas. Sementara itu, Aron Canet dan Diogo Moreira akan memulai balapan dari baris kedua. Cuaca panas yang berlangsung sepanjang akhir pekan di Misano diprediksi akan tetap sama dalam kualifikasi Moto2. Sebanyak 16 pembalap turut ambil bagian dalam Q1, dengan Arbolino memimpin di depan Ivan Ortola dan Darryn Binder.
Pembalap yang berhasil menjadi yang terdepan sebelum pergantian ban adalah David Alonso, yang kemudian disalip oleh Diogo Moreira. Namun, Arbolino berhasil merebut posisi teratas setelah pergantian ban dengan mencatat waktu 1:34,420. Klasifikasi di Q2 pun berubah, dengan Dani Holgado menjadi yang tercepat diikuti oleh Manu Gonzalez dan Aron Canet. Gonzalez berupaya untuk mengalahkan Holgado namun kehilangan waktu tercepat di lap terakhir.
Dengan demikian, Holgado berhasil meraih pole position di Misano setelah meraih kemenangan di Barcelona. Vietti berada di urutan kedua disusul oleh Gonzalez, Baltus, Canet, dan Moreira di baris kedua. Sisa dari grid tersusun oleh beberapa pembalap termasuk Senna Agius, Tony Arbolino, Jake Dixon, Albert Arenas, dan beberapa lainnya.
